MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Legionella pneumophila 2300/99 Alcoy chromosome

Total Repeats: 65524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014125	ACT	2	6	210	215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296105498
2	NC_014125	TTG	2	6	237	242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296105498
3	NC_014125	AGC	2	6	307	312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296105498
4	NC_014125	TTA	2	6	321	326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105498
5	NC_014125	TCGTT	2	10	335	344	0 %	60 %	20 %	20 %	296105498
6	NC_014125	T	8	8	365	372	0 %	100 %	0 %	0 %	296105498
7	NC_014125	GTAG	2	8	435	442	25 %	25 %	50 %	0 %	296105498
8	NC_014125	CTG	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296105498
9	NC_014125	A	6	6	522	527	100 %	0 %	0 %	0 %	296105498
10	NC_014125	TAAA	2	8	553	560	75 %	25 %	0 %	0 %	296105498
11	NC_014125	A	6	6	558	563	100 %	0 %	0 %	0 %	296105498
12	NC_014125	TTAT	3	12	660	671	25 %	75 %	0 %	0 %	296105498
13	NC_014125	CATG	2	8	701	708	25 %	25 %	25 %	25 %	296105498
14	NC_014125	AAT	2	6	732	737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105498
15	NC_014125	GTATT	2	10	750	759	20 %	60 %	20 %	0 %	296105498
16	NC_014125	TTG	2	6	775	780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296105498
17	NC_014125	CAAA	2	8	801	808	75 %	0 %	0 %	25 %	296105498
18	NC_014125	GAT	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105498
19	NC_014125	T	6	6	873	878	0 %	100 %	0 %	0 %	296105498
20	NC_014125	T	6	6	906	911	0 %	100 %	0 %	0 %	296105498
21	NC_014125	ACA	2	6	938	943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296105498
22	NC_014125	TTGG	2	8	1015	1022	0 %	50 %	50 %	0 %	296105498
23	NC_014125	CG	3	6	1060	1065	0 %	0 %	50 %	50 %	296105498
24	NC_014125	T	6	6	1125	1130	0 %	100 %	0 %	0 %	296105498
25	NC_014125	TCT	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296105498
26	NC_014125	AGTT	2	8	1273	1280	25 %	50 %	25 %	0 %	296105498
27	NC_014125	A	6	6	1297	1302	100 %	0 %	0 %	0 %	296105498
28	NC_014125	TAAAG	2	10	1319	1328	60 %	20 %	20 %	0 %	296105498
29	NC_014125	AATGGC	2	12	1382	1393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296105498
30	NC_014125	GGT	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296105498
31	NC_014125	GAT	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105498
32	NC_014125	TCT	2	6	1554	1559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296105498
33	NC_014125	A	6	6	1594	1599	100 %	0 %	0 %	0 %	296105499
34	NC_014125	AAG	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105499
35	NC_014125	T	6	6	1674	1679	0 %	100 %	0 %	0 %	296105499
36	NC_014125	TA	3	6	1703	1708	50 %	50 %	0 %	0 %	296105499
37	NC_014125	AAT	2	6	1762	1767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105499
38	NC_014125	AAAAC	2	10	1875	1884	80 %	0 %	0 %	20 %	296105499
39	NC_014125	CTG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296105499
40	NC_014125	ATG	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105499
41	NC_014125	TTG	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296105499
42	NC_014125	CAG	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296105499
43	NC_014125	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105499
44	NC_014125	ATT	2	6	2074	2079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105499
45	NC_014125	TAA	2	6	2130	2135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105499
46	NC_014125	CAAA	2	8	2143	2150	75 %	0 %	0 %	25 %	296105499
47	NC_014125	A	6	6	2164	2169	100 %	0 %	0 %	0 %	296105499
48	NC_014125	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105499
49	NC_014125	TTG	2	6	2221	2226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296105499
50	NC_014125	AT	3	6	2340	2345	50 %	50 %	0 %	0 %	296105499
51	NC_014125	ATTG	2	8	2350	2357	25 %	50 %	25 %	0 %	296105499
52	NC_014125	TTG	2	6	2422	2427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296105499
53	NC_014125	AAT	3	9	2461	2469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105499
54	NC_014125	AAG	2	6	2474	2479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105499
55	NC_014125	TGA	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105499
56	NC_014125	CTG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296105499
57	NC_014125	ATT	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105499
58	NC_014125	ATT	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105500
59	NC_014125	ACG	2	6	2899	2904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296105500
60	NC_014125	CA	3	6	2942	2947	50 %	0 %	0 %	50 %	296105500
61	NC_014125	TGT	2	6	2970	2975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296105500
62	NC_014125	TTAT	2	8	3013	3020	25 %	75 %	0 %	0 %	296105500
63	NC_014125	ATT	2	6	3036	3041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105500
64	NC_014125	ATT	2	6	3103	3108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105500
65	NC_014125	TTA	2	6	3156	3161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105500
66	NC_014125	T	6	6	3251	3256	0 %	100 %	0 %	0 %	296105500
67	NC_014125	AT	3	6	3301	3306	50 %	50 %	0 %	0 %	296105500
68	NC_014125	A	6	6	3341	3346	100 %	0 %	0 %	0 %	296105500
69	NC_014125	GGA	2	6	3362	3367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296105500
70	NC_014125	ACT	2	6	3368	3373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296105500
71	NC_014125	TA	3	6	3406	3411	50 %	50 %	0 %	0 %	296105500
72	NC_014125	CCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296105500
73	NC_014125	CT	3	6	3477	3482	0 %	50 %	0 %	50 %	296105500
74	NC_014125	ACA	2	6	3488	3493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296105500
75	NC_014125	TGA	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105500
76	NC_014125	GCT	2	6	3573	3578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296105500
77	NC_014125	TTAA	2	8	3606	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	296105500
78	NC_014125	CAG	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296105500
79	NC_014125	AAC	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296105500
80	NC_014125	AAT	2	6	3666	3671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105500
81	NC_014125	GTTT	2	8	3697	3704	0 %	75 %	25 %	0 %	296105500
82	NC_014125	GAT	2	6	4130	4135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105501
83	NC_014125	CAT	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296105501
84	NC_014125	GAT	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105501
85	NC_014125	GAA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105501
86	NC_014125	GCT	2	6	4307	4312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296105501
87	NC_014125	TGA	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105501
88	NC_014125	AGA	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105501
89	NC_014125	CA	3	6	4531	4536	50 %	0 %	0 %	50 %	296105501
90	NC_014125	TGA	2	6	4654	4659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105501
91	NC_014125	A	6	6	4670	4675	100 %	0 %	0 %	0 %	296105501
92	NC_014125	GGC	2	6	4694	4699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296105501
93	NC_014125	TTG	2	6	4710	4715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296105501
94	NC_014125	TAAA	2	8	4722	4729	75 %	25 %	0 %	0 %	296105501
95	NC_014125	GTT	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296105501
96	NC_014125	GCAAT	2	10	4799	4808	40 %	20 %	20 %	20 %	296105501
97	NC_014125	ATG	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105501
98	NC_014125	AAC	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296105501
99	NC_014125	TGG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296105501
100	NC_014125	AGC	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296105501
101	NC_014125	AAT	2	6	4916	4921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105501
102	NC_014125	TGA	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105501
103	NC_014125	TTCT	2	8	5001	5008	0 %	75 %	0 %	25 %	296105501
104	NC_014125	CAG	2	6	5076	5081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296105501
105	NC_014125	GCA	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296105501
106	NC_014125	ATT	2	6	5159	5164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105501
107	NC_014125	GCA	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296105501
108	NC_014125	AG	3	6	5180	5185	50 %	0 %	50 %	0 %	296105501
109	NC_014125	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296105501
110	NC_014125	AGG	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296105501
111	NC_014125	TCT	2	6	5423	5428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296105501
112	NC_014125	AAG	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105501
113	NC_014125	GAA	2	6	5477	5482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105501
114	NC_014125	ATC	2	6	5513	5518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296105501
115	NC_014125	CTT	2	6	5564	5569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296105501
116	NC_014125	AG	3	6	5591	5596	50 %	0 %	50 %	0 %	296105501
117	NC_014125	AT	3	6	5611	5616	50 %	50 %	0 %	0 %	296105501
118	NC_014125	TAAAG	2	10	5641	5650	60 %	20 %	20 %	0 %	296105501
119	NC_014125	GAT	2	6	5678	5683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105501
120	NC_014125	GAA	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105501
121	NC_014125	AGA	2	6	5831	5836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105501
122	NC_014125	TGC	2	6	5877	5882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296105501
123	NC_014125	AAG	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105501
124	NC_014125	ACA	2	6	5947	5952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296105501
125	NC_014125	A	7	7	6226	6232	100 %	0 %	0 %	0 %	296105501
126	NC_014125	ACAA	2	8	6235	6242	75 %	0 %	0 %	25 %	296105501
127	NC_014125	AAC	2	6	6292	6297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296105501
128	NC_014125	ACC	2	6	6368	6373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296105501
129	NC_014125	AAG	2	6	6397	6402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105501
130	NC_014125	AT	3	6	6444	6449	50 %	50 %	0 %	0 %	296105501
131	NC_014125	CTA	2	6	6820	6825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296105502
132	NC_014125	GTT	3	9	6841	6849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296105502
133	NC_014125	CAC	2	6	6871	6876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296105502
134	NC_014125	AAT	2	6	6936	6941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105502
135	NC_014125	GA	3	6	7023	7028	50 %	0 %	50 %	0 %	296105502
136	NC_014125	GGT	2	6	7059	7064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296105502
137	NC_014125	GAT	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105502
138	NC_014125	TAA	2	6	7174	7179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105502
139	NC_014125	TCA	2	6	7239	7244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296105502
140	NC_014125	ATA	2	6	7269	7274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105502
141	NC_014125	TAAT	2	8	7290	7297	50 %	50 %	0 %	0 %	296105502
142	NC_014125	TAA	2	6	7349	7354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105502
143	NC_014125	TTA	2	6	7453	7458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105502
144	NC_014125	ATT	2	6	7550	7555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105502
145	NC_014125	TAA	2	6	7673	7678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105502
146	NC_014125	GCCAT	2	10	7777	7786	20 %	20 %	20 %	40 %	296105502
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150	NC_014125	CTT	2	6	7904	7909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296105503
151	NC_014125	TAAG	2	8	7918	7925	50 %	25 %	25 %	0 %	296105503
152	NC_014125	AG	3	6	7924	7929	50 %	0 %	50 %	0 %	296105503
153	NC_014125	TAAT	2	8	7956	7963	50 %	50 %	0 %	0 %	296105503
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157	NC_014125	ACCA	2	8	8146	8153	50 %	0 %	0 %	50 %	296105503
158	NC_014125	A	6	6	8369	8374	100 %	0 %	0 %	0 %	296105503
159	NC_014125	CATT	2	8	8405	8412	25 %	50 %	0 %	25 %	296105503
160	NC_014125	TTC	2	6	8446	8451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296105503
161	NC_014125	TA	3	6	8580	8585	50 %	50 %	0 %	0 %	296105503
162	NC_014125	ATC	2	6	8650	8655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296105503
163	NC_014125	GAA	2	6	8670	8675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296105503
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167	NC_014125	ATG	2	6	8816	8821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105503
168	NC_014125	GCGTA	2	10	8823	8832	20 %	20 %	40 %	20 %	296105503
169	NC_014125	CAA	2	6	8835	8840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296105503
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171	NC_014125	TGCA	2	8	8972	8979	25 %	25 %	25 %	25 %	296105503
172	NC_014125	CCG	2	6	9122	9127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296105503
173	NC_014125	TTTGA	2	10	9187	9196	20 %	60 %	20 %	0 %	296105503
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251	NC_014125	AATT	2	8	14306	14313	50 %	50 %	0 %	0 %	296105509
252	NC_014125	T	6	6	14417	14422	0 %	100 %	0 %	0 %	296105509
253	NC_014125	TGA	2	6	14591	14596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296105509
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262	NC_014125	ACC	2	6	15383	15388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296105510
263	NC_014125	ATA	2	6	15421	15426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296105510
264	NC_014125	TTGA	2	8	15428	15435	25 %	50 %	25 %	0 %	296105510
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266	NC_014125	ATT	2	6	15608	15613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296105510
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499	NC_014125	AAGGC	2	10	28671	28680	40 %	0 %	40 %	20 %	296105520
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